Vraag:
Waarom is fluor of neon niet de laatste elektronenacceptor in cellulaire ademhaling?
Thomas Dang
2018-11-13 17:02:42 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Ik ben een scheikundestudent en leer over periodieke trends. Ik weet dat in de cellulaire ademhaling van (veel organismen) zuurstof dient als de laatste elektronenacceptor vanwege zijn hoge elektronegativiteit.

Als we de periodieke trends toepassen, is fluor echter elektronegatiever dan zuurstof, en het edelgas neon nog meer dan fluor. Waarom zijn beide niet de laatste elektronenacceptor? Ik weet dat in sommige organismen de laatste elektronenacceptor zwavel is. Maar ik heb nog nooit gehoord dat het fluor of neon is. Waarom?

@CarlWitthoft Om heel eerlijk te zijn, moleculaire zuurstof doet veel _interessante_ dingen die schijnbaar onverenigbaar zijn met het leven (en dat was in feite al een paar miljard jaar).
De reden waarom Neon niet de laatste elektronenacceptor is, is simpel: het accepteert geen elektronen ;-). (De kwestie van zijn elektro-negativiteit is blijkbaar ingewikkeld; op de Pauli-schaal wordt er geen toegewezen.)
Stel je voor hoeveel mensen zouden sterven als ze neon moesten inademen. Of fluor. Niet alleen omdat het giftig is (vermoedelijk niet, als we het inademen) maar * waar haal je het in godsnaam vandaan? *
Fluor in de biochemie zou zijn als het hebben van een Tasmaanse duivel als een portemonnee. Soms wil je niet op elk feest het meest extreme personage.
Vijf antwoorden:
Nicolai
2018-11-13 18:51:54 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Een van de belangrijkste redenen dat de moderne (!) biologie zuurstof als elektronenacceptor gebruikt, is de beschikbaarheid.

Ongeveer 2,45 miljard jaar geleden begon zuurstof (O $ _ 2 $ ) zich op te bouwen in de atmosfeer (die heeft op dat moment een veel van de levensvormen / bacteriën gedood). Sindsdien hebben zuurstofverbruikende levensvormen zich kunnen vestigen. Voordien gebruikten de meeste organismen waarschijnlijk voornamelijk (elementaire) waterstof als elektronenacceptoren.

Behalve dat ze niet echt beschikbaar zijn in de atmosfeer, zijn er nog andere redenen waarom fluor of neon geen goede biologische elektronenacceptoren zijn. :

  • Hoewel elementair fluor (F $ _ 2 $ ) inderdaad extreem elektronegatief is, is het zo reactief dat het:
    a) kon niet worden gecontroleerd door biologie [de reactiviteit van zuurstof is waarom het in de eerste plaats zoveel bacteriën doodde] en
    b) komt gewoon niet voor (of blijft tenminste in) in de elementaire toestand in de natuur (er is geen meetbare F $ _ 2 $ in onze atmosfeer).
  • Neon (en andere edelgassen) zijn in theorie ook behoorlijk elektronegatief, eigenlijk zozeer zelfs, dat ze nooit * voorkomen zonder hun elektronen en daarom helemaal niet reageren.

* Het is op de een of andere manier mogelijk om edelgasverbindingen, maar het vereist een zeer specifieke chemie alle reactieomstandigheden, die meestal plaatsvinden onder gecontroleerde door de mens gemaakte omstandigheden (en niet goed zijn voor biologische levensvormen).

Ik vermoed dat een andere reden de eenvoudige beschikbaarheid is. Zuurstof is het meest voorkomende element in de aardkorst, fluor is relatief zeldzaam (> 0,1%) en sterk gebonden in verbindingen.
Er zijn gevallen van * fluorgas * dat in de natuur wordt aangetroffen (in bepaalde mineralen), maar deze zijn vrij zeldzaam. [YouTube] (https://youtu.be/TQDjILTly3s) en persberichten [1] (https://www.internetchemistry.com/news/2012/jul12/elemental-fluorine-nature.php), [2] ( https://www.wiley.com/WileyCDA/PressRelease/pressReleaseId-105111.html)
Merk op dat zuurstof * beschikbaar * was voor organismen ruim voor de GOE, alleen in gebonden vorm.
Ja, probeer F2 in te ademen, het zal niet leuk zijn.
DevSolar
2018-11-13 22:55:27 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Beschikbaarheid en toepasbaarheid.


Beschikbaarheid.

In het begin was er CO2. Het was overvloedig aanwezig in de atmosfeer, en later in de oceanen.

Fluor en neon waren dat niet, en dus evolueerde de ademhaling rond wat beschikbaar was (en is).

Ref .: Paeloclimatology / History of the Atmosphere.


Toepasbaarheid.

Het andere punt over zuurstof is dat het eerder werkt prachtig in beide richtingen. Chloroplasten kunnen met een beetje zonlicht CO2 en H2O gemakkelijk opsplitsen in glucose en O2. Hemoglobine kan zowel O2 als CO2 combineren met slechts een klein verschil in partiële druk. Mitochondriën kunnen de citroenzuurcyclus doorlopen zonder daarbij vernietigd te worden.

Als fluor eenmaal een ander atoom heeft vastgegrepen en een molecuul heeft gevormd, zal het voor een organisme vrij moeilijk zijn om het weer los te laten, en als dat het geval is, wil de fluor reageren met iets , eigenlijk alles, of dat nu goed is voor het organisme of niet.

Aan de andere kant , neon wil niet reageren met anything.


Dus hoewel chemisch er een punt gemaakt moet worden voor de meer energetische oxidator, evolutie / een organisme is niet alleen "geïnteresseerd" in de energie-inhoud. De stof moet beschikbaar zijn en het proces moet enigszins duurzaam zijn. Zuurstof voldeed aan die vakjes, fluor en neon niet.

Zelfs raketwetenschappers, die echt op zoek zijn naar de meest energetische verbindingen die ze in handen kunnen krijgen, lieten het idee van fluor als drijfgas omdat het niet veilig is om in niet-gecombineerde vorm te hanteren. Er zit een les in.

Beschikbaarheid is niet het fundamentele probleem met neon. Zelfs als de helft van de atmosfeer neon was, zouden we het niet gebruiken bij de ademhaling.
@DavidRicherby: Je zou hetzelfde kunnen zeggen over fluor. Beide factoren - onbeschikbaarheid en chemische ongeschiktheid - zijn van toepassing. Beide zouden op zichzelf al voldoende zijn als verklaring.
+1 voor het raketvoorbeeld
@Pere: Ik kan geen betere manier bedenken om indruk te maken op de omvang van de kwaadaardige reactiviteit van fluor en de woedende toxiciteit van veel van zijn verbindingen dan zelfs raketwetenschappers zeggen "nee, daar zal ik niets aan doen". ;-)
Ik denk dat het voorbeeld van de raketwetenschapper gebrekkig is, omdat deze raketwetenschappers toevallig tot een biologisch systeem behoren dat * is * geëvolueerd met behulp van zuurstof. Redeneren na het feit van evolutie onder zuurstofbeschikbaarheid zegt niet dat evolutie onder overheersende fluorbeschikbaarheid niet tot (andere, functionerende) biologische systemen had kunnen leiden. Om nog een voorbeeld te noemen: H₂O is echt een zeer agressief en corrosief oplosmiddel. Maar we zijn perfect aangepast om ermee om te gaan en het te gebruiken, en dus is het prima voor ons, terwijl H₂S dat bijvoorbeeld niet is. Als je echter wat zwaveloxiderende ...
... bacteriën, zal hun "standpunt" aanzienlijk verschillen.
@cbeleites: Wat ons aan de ene kant terugbrengt naar "beschikbaarheid" - H2O was op deze planeet lang voordat het leven bestond, dus het leven evolueerde van nature om tolerant te zijn voor H2O. Overheersende "beschikbaarheid" van fluor zou een overvloed aan fluor * verbindingen * betekenen, en je zou nog steeds voor het probleem staan ​​om die op te splitsen voor een organisme om daadwerkelijk iets met fluor te doen (dat het organisme niet vernietigt). Ik sta open voor een demonstratie van een levensvatbare "ademhalingscyclus" die overeenkomt met fotosynthese / citroenzuurcyclus die werkt met fluor.
@DevSolar: natuurlijk. Als moderne chemicus zou ik beginnen met het raden van celwanden van teflon die HF-oplossing bevatten. Dat wil zeggen, hoewel ik natuurlijk niet kan zeggen hoe en of de dingen zouden zijn geëvolueerd, zou ik verwachten dat een op fluor gebaseerde biologie al met al 'harder' zou zijn (in dezelfde zin als dat onze op zuurstof gebaseerde biologie hardere chemie gebruikt dan de op zwavel gebaseerde (tegenwoordig) niche biologische systemen), maar dan zouden de hele organismen waarschijnlijk meer "gefluoreerd" zijn en dus in staat zijn om met fluor / HF om te gaan. (Ook is enerzijds het verschil in elektronegativiteit tussen zuurstof en fluoride kleiner
tussen zwavel en zuurstof, maar aan de andere kant is er de stap van tweewaardig naar eenwaardig, wat een groot verschil zou zijn). Ook kan de agressiviteit tot op zekere hoogte worden gecompenseerd omdat we misschien kijken naar systemen die werken bij veel koudere temperaturen: 20 ° C is het kookpunt voor HF, het smeltpunt is lager dan -80 ° C. Als u een paar 10s van ° C afneemt, kan dit de reacties tot een geschikt tempo vertragen. Wie weet? ** Samenvatting: Op HF / F₂ gebaseerde biologie zou er zeker heel anders uitzien dan "onze" biologie. Maar dat betekent niet dat het niet kan werken. **
@cbeleites: ... maar niet op aarde, of iets dat er zelfs maar enigszins op lijkt. Dus ... wat het antwoord op de vraag van het OP betreft, is er iets dat moet worden "bewerkt"?
@DevSolar: nee, sorry: ik vind je antwoord leuk - je hoeft het niet te bewerken. Het punt van mijn opmerking is alleen dat de buitenaardse raketwetenschapper (of verbrandingsmotoringenieur) van de HF-planeet fluor misschien een volkomen normaal oxidatiemiddel vindt ... (en misschien problemen heeft als dat beetje H thatO dat ze hebben in de HF in hun systeem ...)
DrSheldon
2018-11-14 04:11:44 UTC
view on stackexchange narkive permalink

De atoomstraal van fluor is net iets groter dan die van koolstof. Wanneer een fluoratoom zich bindt aan een koolstofatoom dat deel uitmaakt van een koolstofruggengraat, bedekt het fluoratoom niet alleen de C-F-binding maar ook de aangrenzende C-C-bindingen. Dit maakt het voor biologische enzymen onmogelijk om toegang te krijgen tot deze bindingen om ze te verbreken, en daarom zijn gefluoreerde verbindingen biologisch inert.

Dit is de reden waarom we water en tandpasta fluorideren; bacteriën hebben geen enzymen die het met fluor gevormde glazuur kunnen afbreken! Het is ook de reden waarom teflon (herhalende eenheden van -CF $ _ 2 $ -) niet biologisch afgebroken maar verzadigde vetzuren is (herhalende eenheden van -CH $ _ 2 $ -) worden gemakkelijk biologisch afgebroken.

Alle elementen die biologisch worden gebruikt, hebben ecologische cycli waarin ze worden hergebruikt voor andere doeleinden. Omdat gefluoreerde verbindingen niet kunnen worden afgebroken, zou zo'n ecologische cyclus snel tot stilstand komen. Daarom heeft fluor een evolutionair nadeel ten opzichte van andere elementen.

Ik ben het eens met de andere antwoorden dat neon geen elektronenacceptor kan zijn omdat het zich niet tot verbindingen vormt. Ik ben het niet eens met hun argument "zuurstof eerst"; het maakt evolutie niet uit welke mechanismen het eerst evolueren. Als een metabolische route van fluor effectiever was geweest dan die van zuurstof, zou de route uiteindelijk de eerder ontwikkelde route overtreffen. Bovendien zijn er tal van sporenelementen (bv. Selenium) die door het leven worden gebruikt.

Evolutie geeft enigszins om welk mechanisme het eerst evolueert: het heeft de neiging om een ​​* lokaal * optimum te zoeken, niet een * globaal * optimum. Als de voordelen van een zuurstofroute en een fluorroute vergelijkbaar zijn, en beide een groot voordeel zijn ten opzichte van wat ervoor kwam, zal de evolutie waarschijnlijk "vastlopen" op de eerste die zich ontwikkelt.
@Mark Dat is waar, maar dan krijg je zoiets als de evolutie van fotosynthese, en alles wordt de hele wereld uit de klap gegooid. Het is niet ondenkbaar dat hetzelfde zou kunnen gebeuren met zoiets als fluor, * als het beschikbaar was *. Het beschikbaarheidsargument is veel sterker - ongeacht het nut kan het leven het niet gebruiken als er geen bron voor is. De verhoudingen van elementen in het leven komen redelijk dicht in de buurt van de verhoudingen van biologisch beschikbare elementen (bijvoorbeeld inclusief het "geen enzymen" -argument) in de bodems en oceanen van de aarde.
jk - Reinstate Monica
2018-11-13 23:22:33 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Neon werkt gewoon niet als elektronenacceptor. Het is zo inert dat er momenteel helemaal geen neonverbindingen bekend zijn.

Fluor zou in principe werken, maar het is zeldzaam in vergelijking met zuurstof en de sterke reactiviteit maakt het een zeer gevaarlijke stof in elementaire vorm. Het lijkt dus heel natuurlijk dat het leven voor zuurstof kiest en niet voor fluor.

Zuurstof is natuurlijk * ook * een vreselijk gevaarlijke stof - het is gewoon dat de evolutie leven heeft geschapen dat ermee om kan gaan. Zelfs dan is het een evenwichtsoefening en zijn zuurstof (en zuurstofverbindingen) verantwoordelijk voor nogal wat celdood en kankergroei: P De Grote Oxygenatie-gebeurtenis doodde bijna al het leven op het aardoppervlak / de oceanen. Maar toegegeven, het omgaan met fluor zou nog erger zijn, en misschien zelfs onmogelijk (onder standaard druk en temperatuur).
user40249
2018-11-14 18:06:42 UTC
view on stackexchange narkive permalink

De reden is dat gratis fluor niet in de natuur voorkomt en dat neon een edelgas is. Ik zou aannemen dat zuurstof de enige vrije en overvloedige elektronenacceptor in onze biosfeer is.

1) Fluor reageert met elk element op een paar uitzonderingen na (sommige edelgassen) en zal dus onmiddellijk worden gebonden, zelfs als het constant ergens wordt geproduceerd.

2) Vanwege zijn elektronegativiteit is de energie om fluor uit complexen te bevrijden erg hoog, dus de efficiëntie van fotosynthese zal waardeloos zijn.

3) In de veronderstelling dat er een atmosfeer van fluorgas zou zijn, kan op koolstof gebaseerd leven niet bestaan, omdat fluor reageert met koolstof die al beneden kamertemperatuur is.

De opmerking hieronder waarin staat dat fluor zeldzaam is, is ronduit verkeerd. Het is niet zo gewoon als zuurstof, maar het hoeft niet zo te zijn. Bijv. koolstof is ook zeldzaam in vergelijking met zuurstof. Het grootste probleem is een gebrek aan toegankelijkheid vanwege de stabiliteit en de hoge energie die nodig is om het te bevrijden, in verband met het feit dat het elk eiwit zou vernietigen. Een geschikte elektronenacceptor moet metastabiel zijn en naast leven op koolstofbasis kunnen bestaan.

Vrije zuurstof * ook * bestond niet in de natuur toen het leven voor het eerst werd gevormd. Het moest worden bevrijd door fotosynthese. Het belangrijkste is dat fluor zelfs in verbindingen erg schaars is, vergeleken met zoiets als zuurstof. Hoewel zijn overvloed voldoende zou zijn als het een micronutriëntrol zou spelen, is het zeker niet genoeg om zoiets als de laatste elektronenacceptor te zijn. En dan zijn er nog de andere tientallen redenen waarom fluor niet zou werken, zoals het feit dat het (en zijn verbindingen) niet oplossen in water ...
Hoe dan ook, gratis fluor heeft nooit bestaan ​​en was daarom ook nooit een optie. Het zal ook nooit een optie zijn, want zelfs als het door planten zou worden geproduceerd, zou het onmiddellijk reageren met iets anders. Dit betekent dat het nooit een vrije elektronenacceptor zal zijn. Nergens in het universum.
Dit bronverzoek is dom.


Deze Q&A is automatisch vertaald vanuit de Engelse taal.De originele inhoud is beschikbaar op stackexchange, waarvoor we bedanken voor de cc by-sa 4.0-licentie waaronder het wordt gedistribueerd.
Loading...