Aangezien u plant / dier / wat dan ook zei, bied ik de kleinste genomen in verschillende categorieën aan ...

(Kb betekent kilobasen, Mb betekent megabasen. 1 Kb = 1000 basenparen, 1 MB = 1000 Kb)

• Kleinste plantengenoom: Genlisea margaretae op 63 MB ( Greilhuber et al., 2006)
• Kleinste diergenoom : Pratylenchus coffeae (nematode worm) bij 20 MB ( Animal Genome Size DB)
• Kleinste gewervelde genoom: Tetraodon nigroviridis ( pufferfish) op 385 MB ( Jailon et al., 2004)
• Kleinste eukaryoot: Encephalitozoon cuniculi (microsporidian) op 2,9 MB ( Vivarès & Méténier, 2004)
• Kleinste vrijlevende bacteriële genoom: Nanoarchaeum eqitans op 491 KB ( Waters et al., 2003)
• Kleinste bacterieel genoom: Carsonella ruddii (endosymbiont) op 160Kb ( Nakabachi et al., 2006)
• Kleinste genoom van alles: Circovirus bij 1,8 KB (slechts 2 eiwitten !!) ( Chen et al., 2003)

Verwijzingen ...

• Chen, C.-L., Chang, P.-C., Lee, M.-S., Shien, J.-H., Ou, S.-J. & Shieh, H.K. (2003) Nucleotidesequenties van ganzencircovirus geïsoleerd in Taiwan. Vogelpathologie: Journal of the W.V.P.A. 32 (2), 165–171.
• Greilhuber, J., Borsch, T., Müller, K., Worberg, A., Porembski, S. & Barthlott, W. (2006) Kleinste angiosperm-genomen gevonden in Lentibulariaceae, met chromosomen van bacteriële grootte. Plantenbiologie. 8 (6), 770-777.
• Jaillon, O., Aury, J.-M., Brunet, F., Petit, J.-L., Stange -Thomann, N., Mauceli, E., Bouneau, L., Fischer, C., Ozouf-Costaz, C., Bernot, A., Nicaud, S., Jaffe, D., Fisher, S., Lutfalla, G., et al. (2004) Genoomduplicatie in de teleostvis Tetraodon nigroviridis onthult het vroege proto-karyotype van gewervelde dieren. Natuur. 431 (7011), 946-957.
• Nakabachi, A., Yamashita, A., Toh, H., Ishikawa, H., Dunbar, HE, Moran, NA & Hattori, M. (2006) Het 160-kilobase-genoom van de bacteriële endosymbiont Carsonella. Wetenschap. 314 (5797), 267-267.
• Vivarès, C.P. & Méténier, G. (2004) Opportunistische infecties: Toxoplasma, Sarcocystis en Microsporidia. In: Parasieten van wereldklasse. Springer VS. pp. 215–242.
• Waters, E., Hohn, MJ, Ahel, I., Graham, DE, Adams, MD, Barnstead, M., Beeson, KY , Bibbs, L., Bolanos, R., Keller, M., Kretz, K., Lin, X., Mathur, E., Ni, J., et al. (2003) Het genoom van Nanoarchaeum equitans: inzichten in vroege archaeale evolutie en afgeleid parasitisme. Proceedings of the National Academy of Sciences van de Verenigde Staten van Amerika. 100 (22), 12984–12988.

Ik wil zeggen Mycoplasma genitalium met een genoomgrootte van 582.970 bp. Blijkt dat het antwoord Nanoarchaeum eqitans is met een genoom van 490.885 bp.

http://en.wikipedia.org/wiki/Nanoarchaeum

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14566062

Zowel Mycoplasma genitalium als Nanoarchaeum equitans zijn obligate parasieten / endosymbionten. Dit betekent dat ze sterk afhankelijk zijn van hun gastheer om hun vitale functies te ondersteunen en dat ze veel van hun eigen genen hebben verloren.

Een echt vrij levend organisme met een extreem klein genoom (~ 1309 kbp, 1354 genen) is de heterotrofe mariene alfa-proteobacterium Pelagibacter ubique [1].

Bekijk hier een grotere analyse: https://alamot.github.io/smallest_genome/

[1]: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16109880 Giovannoni SJ, Tripp HJ, Givan S, Podar M, Vergin KL, et al. (2005). "Genoomstroomlijning in een kosmopolitische oceanische bacterie". Science 309: 1242-1245.

Kleinste vrijlevende bacteriële genoom: Nanoarchaeum eqitans op 491Kb (Waters et al., 2003). Ik heb dit artikel gedownload en er staat dat dit archaea is en zijn obligate symbiont, geen vrij levende bacterie. Lees aandachtig en upload het dan.