Vraag:
Hoe moet ik plasmiden verzenden?
Nick T
2011-12-15 03:26:35 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Ik heb 10 µL van mijn vector miniprep naar een medewerker gestuurd in een 1,5 ml eppendorf parafilmed afgesloten en gevuld in een conische van 50 ml met wat papieren handdoekjes. Er gebeurde echter iets onderweg en er was niets (geen vloeistof) in de buis toen deze arriveerde. Ze maakten geen opmerkingen over het openklappen van de microcentrifugebuis of kapotte parafilm, dus er gebeurde niets geks maar er gebeurde iets.

Wat is de meest betrouwbare manier om plasmiden te verzenden?

Zes antwoorden:
#1
+17
Jonas
2011-12-15 03:38:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Een redelijk veilige manier om plasmiden te verzenden, is door ze op filterpapier te plaatsen (zie protocol en een brief te sturen. Veel goedkoper.

+1 Snel, gemakkelijk en zeer stabiel, zelfs voor overzeese zendingen.
Bovendien is de douane veel minder kieskeurig over een stuk papier dan over alles wat vloeibaar is.
Dit is de beste manier om te gaan. Je kunt het filtreerpapier ook in een beetje huishoudfolie wikkelen, voor het geval dat.
#2
+12
AnnaF
2011-12-15 03:37:16 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Hebben ze geprobeerd de buis te centrifugeren toen hij daar aankwam om alle vloeistof naar de bodem te duwen? Ik weet dat vooral bij het werken met zulke kleine hoeveelheden dat zelfs door het een beetje te schudden de inhoud over de buis kan worden verspreid. We hebben eerder plasmiden van andere laboratoria ontvangen. Over het algemeen worden de plasmiden verzonden in microcentrifugebuisjes met schroefdop in een soort bus. Dit wordt vervolgens verpakt in een kleine schuimkoeler met droogijs om alles koud te houden.

#3
+12
Mac Cowell
2011-12-15 04:36:41 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Samenvatting

  • de 10 uL plasmide miniprep is mogelijk in de dop van het buisje (AnnaF) gespetterd.
  • het eppendorfbuisje kan tijdens het luchtvervoer drukloos zijn geworden en de 10 uL hebben laten ontsnappen en verdampen.
  • oplossing: probeer uw minipreps aan de lucht te drogen of te deppen (Jonas) voorafgaand aan luchtvervoer

Details

Zoals AnnaF schreef, had de 10 uL van je plasmide verborgen kunnen zijn in de dop of verspreid over de buis, waardoor het leek alsof het leeg was. Neem contact op met uw medewerkers om er zeker van te zijn dat ze het gecentrifugeerd hebben.

Volgens een fedex-document over de verzending van perishables (pdf) en een paper over de temperatuur en druk van luchtvrachten (pdf), FedEx en UPS-luchtzendingen kunnen te maken krijgen met lage-drukomgevingen rond 0,56 - 0,74 atmosfeer (atm). Bij deze relatief lage drukken kan misschien een eppendorfbuis die is afgesloten bij 1 atm. Breken. De kranten merken ook op dat zendingen over de grond die de rockies passeren (dwz in Colorado) ~ 0,64 atm kunnen ervaren.

Dus misschien is uw 1,5 ml eppendorfbuisje tijdens de verzending drukloos gemaakt?

Het zou interessant zijn om wat tests uit te voeren met betrekking tot de drukwaardigheid van eppendorfbuizen.

Wat betreft de oorspronkelijke vraag, heb ik in 2007 een bibliotheek van duizenden miniprepels voorbereid en verzonden (fedex) naar honderden gebruikers. 1 ul miniprep werd in putjes van platen met 384 putjes gedoseerd en aan de lucht gedroogd, vervolgens afgesloten met aluminium en vervolgens per post verzonden. Gebruikers hydrateren een put met 10 uL water. Over het algemeen werkt het.

#4
+5
chaoticdawn
2011-12-22 04:14:23 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Omdat buisjes in de post kunnen worden verpletterd, is de veiligste manier om plasmiden te verzenden door een paar uL in een filtreerpapier te druppelen, het vervolgens in te pakken om het af te sluiten met parafilm en een gedetailleerd formulier over de inhoud in te vullen.

Veel succes.

#5
+4
gkadam
2011-12-24 10:45:16 UTC
view on stackexchange narkive permalink

We zijn in soortgelijke situaties terechtgekomen toen andere laboratoria ons plasmiden hebben gestuurd (of wanneer we oude buisjes uit opslagdozen bij -20 hebben gehaald) en sindsdien de filterpapiermethode hebben overgenomen. Een ander punt om op te merken is dat je bijvoorbeeld 10 μL water aan de "lege" buis (Mac) kunt toevoegen en 1 μL kunt gebruiken voor een transformatie. Het heeft altijd voor ons gewerkt. DNA is schijnbaar onzichtbaar!

#6
+1
user560
2012-03-04 09:38:57 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Ik zal ook sterk aanbevelen om een ​​microgram van je plasmide-DNA op een stuk filtreerpapier te deppen (het filtreerpapier is belangrijk voor extractie aan de ontvangende kant). Het is ook heel erg handig als u de hoeveelheid DNA (ongeveer) duidelijk aangeeft en het uitgewiste DNA in de pen omcirkelt, zodat er geen onduidelijkheid bestaat over het uitsnijden van de cirkel van filtreerpapier met het DNA.

Aan aan de ontvangende kant, moet u het papier altijd meteen invriezen of het DNA van het papier in TE-buffer of water elueren en dan invriezen. Als u dit niet doet, zal dit uiteindelijk leiden tot DNAase-degradatie van het plasmide-DNA en dan moet u wachten op een nieuwe verzending.



Deze Q&A is automatisch vertaald vanuit de Engelse taal.De originele inhoud is beschikbaar op stackexchange, waarvoor we bedanken voor de cc by-sa 3.0-licentie waaronder het wordt gedistribueerd.
Loading...